MetaCAP 检测性能优异！金域参与的血流感染病原学诊断研究发现……
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4月30日，上海复旦大学附属中山医院胡必杰教授团队携手金域医学（603882）研究团队在权威期刊《Journal of Thoracic Disease》发表关于MetaCAP （基于捕获原理的靶向高通量测序技术）在血流感染（BSI）病原学诊断方面的最新研究成果。
该研究表明：MetaCAP 在BSI病原学诊断方面，相较于mNGS和血培养，其敏感性更高且检测时间更快，能更精准、快速鉴定BSI病原体，对指导抗感染治疗具有重要意义，且具有极高的卫生经济学意义，应用前景广阔。
值得注意的是，在本次研究中，MetaCAP 1M数据量检出率达91%，相比mNGS 100M数据量69%的检出率，检测性能优异。文章一经发表，便引起了行业的广泛关注。
临床急需更敏感、快速、实惠的
病原学诊断方法
BSI是一种危及生命的疾病，由病原入侵血液导致感染，相关死亡率较高。延迟诊断和无效治疗可能导致脓毒性休克、多器官功能衰竭、弥散性血管内凝血（DIC）甚至死亡。因此，快速而准确的病原学诊断对于BSI的最佳治疗和预后至关重要。
近年来，非培养法如聚合酶链反应（PCR）和宏基因组下一代测序（mNGS）已应用于BSI病原学诊断中，但PCR需要特异性引物，病原鉴定数量有限；而mNGS在血液标本中的检测性能不尽如人意，如用血浆检测，会出现漏检胞内菌的情况；而全血检测，则受人源背景影响比较大。此外，mNGS检测费用昂贵，也限制了其在临床中的广泛应用。因此，临床迫切需要一种更敏感、快速且成本效益高的方法来诊断BSI。
MetaCAP 的诞生
为临床提供新的研究方向
MetaCAP ，即病原体宏基因捕获测序技术，是金域医学将探针捕获技术与NGS技术融合，自主研发出以“去宿主+百万探针捕获”为技术特色的新产品。其具备广谱、超敏、重点关注RNA病毒基因组全覆盖、兼容病毒同源突变、覆盖重点关注病原的耐药位点等特点，既兼顾了mNGS的“宏”和tNGS高灵敏度优势，又解决了无菌体液和组织病原核酸测序痛点，还具备高性价比。
基于该技术，胡必杰教授团队携手金域医学的科研团队，在血流感染方向开展了相关研究，比较MetaCAP 与血培养和mNGS在检测潜在致病微生物方面的性能差异。
实验方法
在2023年11月24日至12月30日期间，上海复旦大学附属中山医院前瞻性纳入了80名疑似BSI患者。对所有入组患者的血液标本进行培养、mNGS和MetaCAP 检测分析。此外，部分患者还进行了血液MetaCAP 结果与其他标本培养或mNGS检测结果的一致性对比。
研究结果
1、与血培养及mNGS相比，MetaCAP 检测敏感性为91.3%，特异性100%
值得注意的是，在本研究中，MetaCAP 使用的是1M数据量（91.3%检出率），mNGS使用的是100M数据量（69.6%检出率）。
与血培养及mNGS相比，MetaCAP 检测敏感性为91.3%，特异性为100%[1]
2、与血培养相比，MetaCAP 检出微生物种类更多，对于混合感染更具优势
在16例血培养阳性患者中，MetaCAP 同样全部检出，两者一致检出的有13例（81.3%），另外3例（18.8%）MetaCAP 检测到潜在病原体：肠球菌属、金黄色葡萄球菌和念珠菌。两种方法检测到的最常见微生物是肠道杆菌科、肺炎克雷伯菌和大肠杆菌。血液培养阴性53例，MetaCAP 阳性47例（88.7%），检测到56种微生物，有8名检测出多种微生物感染。
3、与mNGS相比，MetaCAP 检测更具敏感性及性价比
在48例血液mNGS阳性患者中，MetaCAP 结果也全部为阳性，其中42例（87.5%）与mNGS结果一致，另外5例（10.4%）MetaCAP 检测到其他潜在病原体：念珠菌、金黄色葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、肠球菌；1例（2.1%）mNGS检测到惰性乳杆菌，但MetaCAP 未检测到。两种方法检测到的最常见的微生物是肺炎克雷伯菌，其次是肠球菌。21例mNGS阴性患者中，MetaCAP 阳性15例（71.4%），检测到17种新微生物，其中2例患者检测出多微生物感染。
与mNGS相比，MetaCAP 检测更具敏感性及性价比[1]
值得特别关注的是，在真菌和胞内细菌如肺炎支原体、军团菌、恙虫病原体、沙门氏菌、布鲁氏菌、库克杆菌以及结核分枝杆菌等方面，MetaCAP 检出能力优于mNGS（见下图）。原因是mNGS与MetaCAP 的检测原理和流程不一样，在本研究中，MetaCAP 在探针捕获的基础上，明显减少了人源背景的影响，大大减少胞内菌的漏检情况，采用DNA+RNA共检测，成本降低，更具性价比。
MetaCAP 检出能力优于mNGS[1]
4、MetaCAP 与其他标本培养或mNGS检测结果对比，一致性高
69例BSI患者，23例患者进行其他标本类型的培养或mNGS，21例（91.3%）的MetaCAP 结果与其他标本的培养或mNGS检测到的微生物一致。
5、MetaCAP 结果对临床抗生素使用有明显指导意义
在69名BSI患者中，有22例根据MetaCAP 结果调整抗感染治疗后观察到临床改善情况。在这22名患者中，6名（27.3%）血培养呈阳性，17名（77.3%）mNGS呈阳性，而MetaCAP 则均呈阳性。至于其余47例BSI患者，其MetaCAP 结果与临床医生初步评估一致并继续执行最初的抗感染治疗方案。
除上述结果外，研究还对不同检测方法的TAT做了分析：血培养为50.1+9.9小时、mNGS为30.5小时、MetaCAP 只需要16小时。由此可见，MetaCAP 的TAT明显优于血培养和mNGS。
MetaCAP 在BSI病原学诊断
应用前景广阔
研究团队进一步总结道：“相较于血培养和mNGS，MetaCAP 对于BSI血液标本中具有高敏感性。特别是在真菌和胞内细菌如肺炎支原体、军团菌、恙虫病原体、沙门氏菌、布鲁氏菌、库克杆菌以及结核分枝杆菌等，MetaCAP 检出能力优于mNGS。
在特异性方面，mNGS和MetaCAP 之间无显著差异。另外，相较于血培养和mNGS，MetaCAP 展现出更快的报告时间（TAT），并有22例BSI患者中根据MetaCAP 结果调整抗感染治疗后观察到临床改善情况。
在他们看来，MetaCAP 在BSI病因诊断方面，应用前景广阔。相较于mNGS和血培养，MetaCAP 敏感性更高且检测时间更快，能更精准、快速鉴定引起BSI的病原体，并指导抗感染治疗具有重要意义，具有极高的卫生经济学意义。
来源：金域医学官微
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